Recibió su título de Doctor en Cirugía Dental en la Universidad de Santo Domingo en 1949. Luego se trasladó a los Estados Unidos, donde realizó un Fellowship en periodoncia en la Universidad de Columbia (New York, NY) y obtuvo el título de Especialista en Ortodoncia de la Universidad de Pennsylvania (Philadelphia, PA) en 1952.

Formó parte del equipo de profesores fundadores de la Escuela de Odontología de la Universidad Nacional Pedro Henriquez Ureña para el 1966, donde impartió clases por más de 20 años. También fue profesor de la Escuela de Odontología de la Universidad Autónoma de Santo Domingo y profesor invitado del Postgrado en Ortodoncia de la Universidad Iberoamericana.

Fue el ideólogo y presidente fundador de la Sociedad Dominicana de Ortodoncia, a la cual sirvió como presidente desde su fundación en 1979 hasta 1993. Por sus grandes aportes a esta institución fue elevado a la categoría de Miembro de Honor luego de su retiro de la presidencia.

Presentó importantes trabajos sobre técnicas de ortodoncia en los congresos de la American Association of Orthodontists en San Francisco, CA (1995) y Toronto, Canada (2001). También publicó artículos en el Journal Of Clinical Orthodontics y en la Revista de la Asociación Argentina de Ortodoncia.

El Dr. Hernández Mota fue un hombre de grandes pasiones en diversas facetas de la vida. Disfrutaba de la montaña, música, películas y cocina, además de pasar el tiempo junto a su familia. Estuvo casado por más de 60 años con Luisa Amelia Bonnelly, con quien formó una familia unida de 5 hijos: Aida Consuelo, Amelia, Susana, Rafael Alberto y Juan Carlos.

Falleció el día 27 de marzo del año 2015.